Il dure 2 mois au minimum mais peut être prolongé jusquà 5 mois durant les périodes d'interruption pédagogique. Selon les parcours, il est crédité de 6 à 9 ECTS et est organisé en avril-mai (en janvier février pour le parcours PLANT-Int).

La durée du stage de Master 2 est de 6 mois (janvier à juin , les dates peuvent être différentes pour les parcours Pro).
Le stage de Master 2 (27 ECTS) représente une partie importante de la formation. Selon les parcours, il permet l’évaluation des aptitudes des étudiants à s’orienter vers les métiers de la recherche en poursuivant par une thèse de doctorat. Il est aussi considéré comme un stage de fin d’études, qui permet aux étudiants de s’insérer dans le monde professionnel et d’y développer ses compétences.